Evaluation of virulence factors in clinical isolates of pathogenic E. coli in avian samples in Caloto, Colombia

Avian pathogenic E. coli (APEC), produces an extraintestinal infection in chickens, turkeys, and other types of birds, called colibacillosis, which is considered one of the main causes of economic losses due to morbidity, mortality, and discard of poultry carcasses. The objective of the present study was to characterize the genetic profile of the virulence factors of different isolates of avian E. coli in Caloto, Cauca, Colombia. Materials and methods: E. coli was isolated and identified by biochemical tests, from 47 clinical isolates. Subsequently, the DNA was extracted using Chelex. Three multiplex PCRs were designed to amplify 13 virulence factors (iroN, hlyF, iss, iutA, frz, vat, sitA, KpsM, sitD, fimH, pstB, sopB, and uvrY), using primers previously reported for each. At the end, the amplification products were verified on agarose gels. Each isolate was classified according to the number of virulence factors: group A (between 10 and 13), group B (between 5 and 9), and group C (4 or less). Discussion and Conclusions: we were able to identify the presence of a group of virulence factors in clinical isolates of APEC, which allows us to demonstrate that both the frequency and the profile of virulence factors in the isolated strains showed a different profile than the reported by other authors. The virulence genes pstB and fimH were detected in all our samples, and the iss gene was the one with the lowest frequency. Finally, according to the number of virulence factors, the group A was the most frequent.

La E. coli patógena aviar (APEC), produce una infección extraintestinal en pollos, pavos y otros tipos de aves, denominada colibacilosis, la cual es considerada una de las principales causas de pérdidas económicas por morbilidad, mortalidad y descarte de canales de aves. El objetivo del presente estudio fue caracterizar el perfil genético de los factores de virulencia de diferentes aislamientos de E. coli aviar en Caloto, Cauca, Colombia. Materiales y métodos: E. coli se aisló e identificó mediante pruebas bioquímicas, a partir de 47 aislamientos clínicos. Posteriormente, el ADN se extrajo utilizando Chelex. Se diseñaron tres PCR multiplex para amplificar 13 factores de virulencia (iroN, hlyF, iss, iutA, frz, vat, sitA, KpsM, sitD, fimH, pstB, sopB y uvrY), utilizando primers informados previamente para cada uno. Al final, los productos de amplificación fueron verificados en geles de agarosa. Cada aislamiento se clasificó según el número de factores de virulencia: grupo A (entre 10 y 13), grupo B (entre 5 y 9) y grupo C (4 o menos). Discusión y Conclusiones: pudimos identificar la presencia de un grupo de factores de virulencia en los aislados clínicos de APEC, lo que nos permite demostrar que tanto la frecuencia como el perfil de los factores de virulencia en las cepas aisladas presentaron un perfil diferente al reportado por otros autores. Los genes de virulencia pstB y fimH se detectaron en todas nuestras muestras, siendo el gen iss el de menor frecuencia. Finalmente, según el número de factores de virulencia, el grupo A fue el más frecuente.

Frecuencia de infección urinaria en lactantes con fiebre sin foco infeccioso evidente que consultan a la Unidad Vida Infantil de la Universidad de Antioquia del Hospital Francisco Valderrama, Turbo (Antioquia) / Frequency of urinary tract infections in febrile infants without evidence of an infectious source, from the clinic of the unidad vida infantil of the university of antioquia, hospital francisco valderrama, Turbo, Colombia

OBJETIVO: establecer la frecuencia de infección urinaria en lactantes febriles menores de dos años de edad atendidos en la Unidad Vida Infantil de la Universidad de Antioquia y en el Hospital Francisco Valderrama de Turbo Antioquia, entre el 1º de febrero de 2003 y el 31 de enero de 2004. MÉTODOS: se incluyeron cincuenta niños menores de 24 meses de edad con fiebre sin causa aparente, entendiéndose como tal una enfermedad febril aguda en la que no se encuentra la causa luego de anamnesis y examen físico cuidadosos. Se realizaron los siguientes exámenes de laboratorio: leucograma, sedimentación, tirilla en orina para detectar estearasa leucocitaria y nitritos, uroanálisis (UA) (leucocitos en orina por mm3), tinción de gram de una gota de orina sin centrifugar, uroanálisis microscópico (leucocitos y bacterias por campo de alto poder) y urocultivo cuantitativo (se consideró positivo cuando se encontraron más de 10.000 unidades formadoras de colonias, UFC, por ml). Todas las muestras de orina se obtuvieron por sonda vesical. Para cada una de las pruebas se determinó la sensibilidad, la especificidad y el valor predictivo positivo y negativo. RESULTADOS: la frecuencia de infección urinaria (crecimiento de más de 10.000 UFC de un patógeno urinario por ml) fue 10 por ciento. La edad promedio fue siete meses. La mayoría de los niños con infección urinaria tenía anorexia, irritabilidad, malestar general y vómito. Los parámetros de laboratorio más específicos fueron tinción de gram positiva (cualquier bacteria) y piuria (>10 leucocitos por campo de alto poder). Todas las infecciones urinarias fueron causadas por CONCLUSIONES: la infección urinaria es una causa frecuente de síndrome febril agudo sin causa aparente en lactantes, en Turbo, Antioquia. En tales casos, los médicos deben ordenar un UA (leucocitos y bacterias por campo de ato poder) y tinción de gram. Si los resultados de estas pruebas son positivas, debe hacerse urocultivo. En este estudio las cepas de Escherichia coli identificadas mostraron resistencia a antibióticos frecuentemente utilizados.

ABSTRACT BACKGROUND: in infants, it has been documented that urinary tract infections (UTI) are a common cause of the acute febrile syndrome without apparent source for the fever. According to the results of some research, the prevalence of UTI varies between 4% and 13%. In infants, especially those under the age of 2 years, UTI are associated with an increased incidence of vesicoureteral reflux and renal parenchymal involvement. Moreover, this group of patients with UTI require special attention in order to prevent renal scarring, hypertension and chronic renal failure. OBJECTIVE: to establish the prevalence rate of UTI in febrile infants under 24 months of age, admitted to the Vida Infantil" Department of the University of Antioquia and the Francisco Valderrama Hospital in Turbo, Antioquia, (Colombia), from February 1st, 2003 through January 31st, 2004. METHODS: a total of 50 children under 24 months of age who had been admitted to the aforementioned Department were enrolled in this prospective study. Patients had fever the cause of which was not definitely known. The following laboratory tests were performed: white blood cell total and differential count (WBC), erythrocyte sedimentation rate (ESR), urine dipstick tests for leukocyte esterase and nitrites, urinalysis (UA) (urine white blood cell count/mm3), gram stain in a drop of uncentrifuged urine, microscopic UA (white blood cells and bacteria per high-powered field), and quantitative urine culture (positive urine results were defined as ³104 colony-forming units of an urinary tract pathogen per mL). All urine specimens were obtained by urethral catheterization. Sensitivity, specificity, and accuracy likelihood ratios were determined for each one of the screening tests. RESULTS: overall prevalence of UTI (growth of >104 CFU of an urinary tract pathogen per mL) was 10%. Average age was 7 months. Most children with UTI had anorexia, irritability, general malaise, and vomiting. The most specific laboratory parameters were urine positive gram stain (any bacteria), and pyuria (>10 WBC/high-powered field). All urinary tract infections were caused by Escherichia coli. Isolates of this urinary pathogen showed decreased susceptibility to trimetoprimsulfametoxasole, as well as resistance to ampicillin. CONCLUSIONS: UTI is a frequent cause of the acute febrile syndrome without apparent source for the fever in infants of Turbo, Antioquia. In such cases, particularly when there are not specific clinical signs or symptoms, physicians should take this disease into consideration, and order an UA (white blood cells and bacteria per high-powered field), and gram stain. If results of these tests are positive, an urine culture becomes necessary. In our study, E. coli isolates showed significant resistance to commonly prescribed antibiotics

Episodios de neutropenia febril en niños con neoplasias malignas / Febrile neutropenia episodes in children with malignant neoplasias

Introducción: la neutropenia febril (NF) es una complicación frecuente del tratamiento del cáncer y es potencialmente letal. El objetivo del estudio fue describir las características de estos episodios en el medio. Materiales y métodos: se incluyeron prospectivamente los pacientes menores de 15 años con episodios de NF atendidos durante 1999. se registraron en formato preestablecidos y se estudiaron con protocolo del Servicio. Resultados: se incluyeron 84 niños/143 episodios de NF; 41,3 por ciento de los episodios correspondieron a pacientes con leucemia linfoide aguda, 25,2 por ciento a linfoma no Hodgkin, 15,4 por ciento leucemia mieloide aguda y 18,1 por ciento a otros tumores. En el 92,3 por ciento se aplicó quimioterapia previa (75 por ciento intensiva), 72 por ciento tuvieron recuento absoluto de neutrofilos < 100 y 9,5 por ciento hipotensión inicial. Se clasificaron como fiebre de origen desconocido 47.6 por ciento, infección clínicamente definida 31.5 por ciento e infección microbiológicamente definida 21 por ciento. En 30 episodios se aislaron microorganismos en uno o más sitios: por hemocultivos 26, urocultivos ocho y otras muestras tres. Los más frecuentes fueron: Escherichia coli (9), Klebsiella pneumoniae (8), Staphylococcus coagulasa negativa (6), Sthaphylococcus aureus (6), Streptococcus grupo viridans (2), Pseudomonas aeruginosa (2). En 16 episodios ocurrieron complicaciones (11.2 por ciento), siendo el choque séptico la más frecuente. Fallecieron nueve pacientes durante el estudio (6.2 por ciento), seis de ellos cultivos positivos. Conclusiones: los hallazgos son similares a lo informado en la literatura; se destaca la importancia de mejorar los estudios virales en el medio y aunque

Agentes etiológicos de diarrea en niños atendidos en la Unidad de Capacitacíon para el Tratamiento de la Diarrea del Hospital Universitario San Vicente de Paúl de Medellín / Diarrhea etiological agents in children seen at the Hospital Universitario San Vicente de Paúl’s Unidad de Capacitación para el Tratamiento de la Diarrea, Medellín

Objetivo: estudiar la presencia de agentes potencialmente productores de diarrea y las características de los niños atendidos en la Unidad de Capacitación para el Tratamiento de la Diarrea, del Hospital Universitario San Vicente de Paúl, de Medellín, entre 1997 y 1999. Materiales y métodos: estudio descriptivo retrospectivo. Entre los 1984 niños atendidos se realizaron los siguientes exámenes de materias fecales: coprológicos 851, coprocultivos: 564, Latex para rotavirus:150, Tinción para Criptosporidium: 142, Tinción para Campylobacter: 137. Se buscó asociación estadística entre las características personales y clínicas que presentaban los niños y los agentes identificados. Resultados: entre los niños analizados se encontró Rotavirus en 48 por ciento, Salmonella spp 11.5 por ciento, Shigella spp 3.5 por ciento, E. Coli enteropatógeno 4.2 por ciento, Criptosporidium spp 15.5 por ciento y Campylobacter spp 5.8 por ciento. Se encontró asociación estadísticamente significativa entre rotavirus y la edad de 6 a 11 meses, OR=2.99(1.45, 6.21), diarrea aguda, OR=2.93 (0.91, 9.95) y ausencia de sangre en las heces, OR=5.10 (1.51, 18.96). Entre la presencia de sangre y Salmonella spp., OR=2.82 (1.60, 4.96) y Shigella spp. OR=4.88 (1.81, 13.38) y entre E. Coli enteropatógeno y deshidratación, OR=4.67 (1.30, 19.89). Conclusiones: principales agentes identificados: Rotavirus y Salmonella spp. Los parásitos son poco frecuentes